El Programa cuenta con un empleado capacitado para asistir a profesores y estudiantes en los procesos y flujos de presentación y comunicación con los Comités de Ética en Investigación (CEP). El Curso de Postgrado “Bases Metodológicas de la Investigación Científica” dedica parte de la carga de trabajo al tema “Buenas Prácticas en Investigación Clínica”. En cuanto a la investigación experimental, el Programa cuenta con la Disciplina específica “MAN5741 - Buenas prácticas anestésicas en la investigación experimental” donde se discute ampliamente el tema.

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El Programa somete los proyectos de investigación a evaluación por cuatro CEP institucionales, según el origen del proyecto propuesto:

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• Comité de Ética en Investigación del Hospital das Clínicas de la Facultad de Medicina de la Universidad de São Paulo ( CAPPesq ): a este CEP, se presentan actualmente los proyectos de investigación clínica a realizarse en los Institutos del Hospital das Clínicas, excepto el Instituto de cáncer. El CEP tiene su propia plataforma digital para la presentación de proyectos y las reuniones de los comités se realizan quincenalmente. Hasta la creación de CEP-FMUSP y CEUA, este CEP era responsable de evaluar todos los proyectos institucionales de investigación.

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• Comité de Ética en Investigación de la Facultad de Medicina de la Universidad de São Paulo ( CEP-FMUSP ): creado en 2011, este CEP se somete a los proyectos de investigación clínica que se realizarán en la Facultad de Medicina, el Instituto del Cáncer e instituciones externas para la Universidad utilizando el CEP institucional. Los estudiantes que vayan a realizar la recolección de datos en otras instituciones deberán tener el proyecto de investigación aprobado en el CEP de la institución de origen y también en este CEP. El CEP cuenta con una plataforma digital propia para la presentación de proyectos y se reúne cada dos semanas para deliberar sobre el análisis preliminar de proyectos realizado por los miembros de la comisión. Desde la creación de este CEP hasta 2013, los proyectos clínicos y los del CEUA (descritos a continuación) fueron evaluados por la misma comisión.

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• Comité de Ética para el Uso de Animales, Facultad de Medicina, Universidad de São Paulo ( CEUA-FMUSP ): con una carta creada en 2010, este Comité de Investigación trabajó en conjunto con CEP-FMUSP hasta 2013, cuando fue oficialmente desmembrado por determinación de la Comisión Nacional de Ética en Investigación.

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• Comité de Ética en Investigación del Hospital Universitario de la Universidad de São Paulo ( CEP-HU ): este CEP está sometido a proyectos de investigación a realizarse en el Hospital Universitario de la Universidad de São Paulo.

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Cuando sea necesario, la comunicación con  CONEP  y  ANVISA  se lleva a cabo a través de los CEP correspondientes a los Proyectos de Investigación.

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Todos los Comités de Ética están compuestos por miembros que se reúnen periódicamente y están vinculados a los órganos reguladores competentes. Hasta la creación de CEP-FMUSP en 2011 y CEUA en 2013, CAPPesq era responsable de evaluar todos los proyectos clínicos y experimentales en animales.

De acuerdo con la legislación vigente, todos los proyectos experimentales con animales se someten a la Comisión de Ética específica (CEUA).

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Los estudiantes involucrados en Proyectos de Investigación Clínica deben registrar el proyecto en la Plataforma.  ClinicalTrials.gov  al iniciar la recopilación de datos.